This looks like a Soaplab service. Click here for more info and guidance on how to use this service )
About Soaplab
Soaplab services are command line applications, wrapped as SOAP services, and served from a Soaplab server. All Soaplab services have the same generic set of SOAP operations (depending on the Soaplab version) as they all share a standardised interface.
Certain tools, like the Taverna workflow workbench, provide automatic support for the Soaplab way of executing these services. In some cases you will need to use the Soaplab Server Base URL rather than the WSDL location in these tools.
More information on Soaplab clients is available here.
Further documentation on Soaplab services is available:
- Soaplab overview
- Soaplab client guide page
- EBI Soaplab server documentation
- Soaplab 2
- Sourceforge site for EMBOSS Soaplab services
Provider:
European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
Location:
United Kingdom
Submitter/Source:
SoapLab Support (over 11 years ago)
Base URL:
http://www.ebi.ac.uk:80/soaplab/typed/services/phylogeny_tree_drawing.fdrawtree
WSDL Location:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/typed/services/phylogeny_tree_drawing.fdrawtree?wsdl(download last cached WSDL file)
Documentation URL(s): SoapLab Support (over 10 years ago) http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.0/emboss/apps/fdrawtree.html Login to add a documentation URL Description(s): from provider’s description doc (over 10 years ago) Plots an unrooted tree diagram
SoapLab Support(over 10 years ago)
Plots an unrooted tree diagram
Login to add a description ELIXIR Description(s): No info yet Login to add an elixir description Details (from Soaplab server): from Soaplab server(over 10 years ago)
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : fdrawtree
- installation : Soaplab2 default installation
- type : Phylogeny Tree drawing
- output :
- description : Plots an unrooted tree diagram
- version : 6.1.0
- analysis_extension :
- input :
- analysis :
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : fdrawtree
- installation : Soaplab2 default installation
- type : Phylogeny Tree drawing
- output :
- description : Plots an unrooted tree diagram
- version : 6.1.0
- analysis_extension :
- option :
- name : emboss
- type : normal
- value : true
- name : installation
- type : normal
- value : Soaplab2 default installation
- name : version
- type : normal
- value : 6.1.0
- event :
- action :
- id : _E_1
- app_info :
- category : phylogeny_tree_drawing
- help_url : http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.1/emboss/apps/fdrawtree.html
- parameter :
- data :
- ioformat : unspecified
- iotype : input
- repeatable :
- base :
- data :
- result :
- iotype : output
- base :
- standard :
- repeatable :
- base :
- standard :
- list :
- name : Plotter or printer
- list_item :
- level : 0
- shown_as : Postscript printer file format
- value : l
- level : 0
- shown_as : PICT format (for drawing programs)
- value : m
- level : 0
- shown_as : HP Laserjet 75 dpi PCL file format
- value : j
- level : 0
- shown_as : HP Laserjet 150 dpi PCL file format
- value : s
- level : 0
- shown_as : HP Laserjet 300 dpi PCL file format
- value : y
- level : 0
- shown_as : MS-Windows Bitmap
- value : w
- level : 0
- shown_as : FIG 2.0 drawing program format
- value : f
- level : 0
- shown_as : Idraw drawing program format
- value : a
- level : 0
- shown_as : VRML Virtual Reality Markup Language file
- value : z
- level : 0
- shown_as : PCX 640×350 file format (for drawing programs)
- value : n
- level : 0
- shown_as : PCX 800×600 file format (for drawing programs)
- value : p
- level : 0
- shown_as : PCX 1024×768 file format (for drawing programs)
- value : q
- level : 0
- shown_as : TeKtronix 4010 graphics terminal
- value : k
- level : 0
- shown_as : X Bitmap format
- value : x
- level : 0
- shown_as : POVRAY 3D rendering program file
- value : v
- level : 0
- shown_as : Rayshade 3D rendering program file
- value : r
- level : 0
- shown_as : Hewlett-Packard pen plotter (HPGL file format)
- value : h
- level : 0
- shown_as : DEC ReGIS graphics (VT240 terminal)
- value : d
- level : 0
- shown_as : Epson MX-80 dot-matrix printer
- value : e
- level : 0
- shown_as : Prowriter/Imagewriter dot-matrix printer
- value : c
- level : 0
- shown_as : Toshiba 24-pin dot-matrix printer
- value : t
- level : 0
- shown_as : Okidata dot-matrix printer
- value : o
- level : 0
- shown_as : Houston Instruments plotter
- value : b
- level : 0
- shown_as : other (one you have inserted code for)
- value : u
- type : full
- repeatable :
- list :
- base :
- standard :
- list :
- name : Previewing device
- list_item :
- level : 0
- shown_as : Will not be previewed
- value : n
- level : 0
- shown_as : MSDOS graphics screen m
- value : I i
- level : 0
- shown_as : X Windows display
- value : x
- level : 0
- shown_as : MS Windows display
- value : w
- level : 0
- shown_as : TeKtronix 4010 graphics terminal
- value : k
- level : 0
- shown_as : DEC ReGIS graphics (VT240 terminal)
- value : d
- level : 0
- shown_as : Other (one you have inserted code for)
- value : o
- type : full
- repeatable :
- list :
- base :
- standard :
- list :
- name : Iterate to improve tree
- list_item :
- level : 0
- shown_as : No
- value : n
- level : 0
- shown_as : Equal-Daylight algorithm
- value : e
- level : 0
- shown_as : n-Body algorithm
- value : b
- type : full
- repeatable :
- list :
- base :
- base :
- name : lengths
- default : false
- mandatory : false
- qualifier : lengths
- prompt : Use branch lengths from user trees
- type : boolean
- ordering : 11
- standard :
- list :
- name : Lable direction
- list_item :
- level : 0
- shown_as : along
- value : a
- level : 0
- shown_as : fixed
- value : f
- level : 0
- shown_as : radial
- value : r
- level : 0
- shown_as : middle
- value : m
- type : full
- repeatable :
- list :
- base :
- range :
- format : %f
- max : 360.0
- min : -360.0
- repeatable :
- base :
- name : treeangle
- default : 90.0
- option :
- name : scalemax
- type : style
- value : 360.0
- name : scalemin
- type : style
- value : -360.0
- mandatory : false
- qualifier : treeangle
- prompt : Angle the tree is to be plotted
- type : float
- ordering : 13
- range :
- format : %f
- max : 360.0
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : arc
- default : 360
- option :
- name : scalemax
- type : style
- value : 360.0
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- mandatory : false
- qualifier : arc
- prompt : Degrees the arc should occupy
- type : float
- ordering : 14
- range :
- format : %f
- max : 360.0
- min : 0.0
- repeatable :
- base :
- name : labelrotation
- default : 90.0
- option :
- name : scalemax
- type : style
- value : 360.0
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.0
- mandatory : false
- qualifier : labelrotation
- prompt : Angle of labels (0 degrees is horizontal for a tree growing vertically)
- type : float
- ordering : 15
- base :
- name : rescaled
- default : false
- mandatory : false
- qualifier : rescaled
- prompt : Automatically rescale branch lengths
- type : boolean
- ordering : 16
- range :
- format : %f
- repeatable :
- base :
- name : bscale
- default : 1.0
- mandatory : false
- qualifier : bscale
- prompt : Centimeters per unit branch length
- type : float
- ordering : 17
- range :
- format : %f
- max : 100.0
- min : 0.1
- repeatable :
- base :
- name : treedepth
- default : 0.53
- option :
- name : scalemax
- type : style
- value : 100.0
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.1
- mandatory : false
- qualifier : treedepth
- prompt : Depth of tree as fraction of its breadth
- type : float
- ordering : 18
- range :
- format : %f
- min : 0.1
- repeatable :
- base :
- name : xmargin
- default : 1.65
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.1
- mandatory : false
- qualifier : xmargin
- prompt : Horizontal margin (cm)
- type : float
- ordering : 19
- range :
- format : %f
- min : 0.1
- repeatable :
- base :
- name : ymargin
- default : 2.16
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.1
- mandatory : false
- qualifier : ymargin
- prompt : Vertical margin (cm)
- type : float
- ordering : 20
- range :
- format : %f
- min : 0.1
- repeatable :
- base :
- name : xrayshade
- default : 1.65
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.1
- mandatory : false
- qualifier : xrayshade
- prompt : Horizontal margin (pixels)
- type : float
- ordering : 21
- range :
- format : %f
- min : 0.1
- repeatable :
- base :
- name : yrayshade
- default : 2.16
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.1
- mandatory : false
- qualifier : yrayshade
- prompt : Vertical margin (pixels)
- type : float
- ordering : 22
- range :
- format : %f
- repeatable :
- base :
- name : paperx
- default : 20.63750
- mandatory : false
- qualifier : paperx
- prompt : Paper width
- type : float
- ordering : 23
- range :
- format : %f
- min : 0.1
- repeatable :
- base :
- name : papery
- default : 26.98750
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.1
- mandatory : false
- qualifier : papery
- prompt : Paper height
- type : float
- ordering : 24
- range :
- format : %f
- min : 1
- repeatable :
- base :
- name : pagesheight
- default : 1
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 1
- mandatory : false
- qualifier : pagesheight
- prompt : Number of trees across height of page
- type : float
- ordering : 25
- range :
- format : %f
- min : 1
- repeatable :
- base :
- name : pageswidth
- default : 1
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 1
- mandatory : false
- qualifier : pageswidth
- prompt : Number of trees across width of page
- type : float
- ordering : 26
- range :
- format : %f
- min : 0.001
- repeatable :
- base :
- name : hpmargin
- default : 0.41275
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.001
- mandatory : false
- qualifier : hpmargin
- prompt : Horizontal overlap (cm)
- type : float
- ordering : 27
- range :
- format : %f
- min : 0.001
- repeatable :
- base :
- name : vpmargin
- default : 0.53975
- option :
- name : scalemin
- type : style
- value : 0.001
- mandatory : false
- qualifier : vpmargin
- prompt : Vertical overlap (cm)
- type : float
- ordering : 28
- data :
- option :
- input :
- name : lengths
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : treeangle
- default : 90.0
- mandatory : false
- type : float
- name : arc
- default : 360
- mandatory : false
- type : float
- name : labelrotation
- default : 90.0
- mandatory : false
- type : float
- name : rescaled
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : bscale
- default : 1.0
- mandatory : false
- type : float
- name : treedepth
- default : 0.53
- mandatory : false
- type : float
- name : xmargin
- default : 1.65
- mandatory : false
- type : float
- name : ymargin
- default : 2.16
- mandatory : false
- type : float
- name : xrayshade
- default : 1.65
- mandatory : false
- type : float
- name : yrayshade
- default : 2.16
- mandatory : false
- type : float
- name : paperx
- default : 20.63750
- mandatory : false
- type : float
- name : papery
- default : 26.98750
- mandatory : false
- type : float
- name : pagesheight
- default : 1
- mandatory : false
- type : float
- name : pageswidth
- default : 1
- mandatory : false
- type : float
- name : hpmargin
- default : 0.41275
- mandatory : false
- type : float
- name : vpmargin
- default : 0.53975
- mandatory : false
- type : float
- analysis :
License(s): No info yet Login to add license info Cost: No info yet Login to add cost info Usage conditions: No info yet Login to add usage conditions info Contact info: No info yet Login to add contact info How to cite this service: No info yet Login to add how to cite info Publications about this service: for this service (this can be in a common citation format like Bibtex, MLA or APA, a DOI, a URL, etc.) No info yet Login to add publications info Citations of this service: No info yet Login to add citations info Example workflows using this service: See all workflows on myExperiment that use this service Login to add workflows info