![header=[] body=[Provider's description doc] cssheader=[boxoverTooltipHeader] cssbody=[boxoverTooltipBody] delay=[200]](/assets/page_white_code-a2f327cbed9ca84c8650d7721293707d.png)
- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : hmoment
- output :
- installation : Soaplab2 default installation
- version : 6.3.0
- type : Protein 2D Structure
- description : Calculate and plot hydrophobic moment for protein sequence(s)
- analysis_extension :
- input :
Show all

- ds_lsr_analysis :
- analysis :
- name : hmoment
- output :
- installation : Soaplab2 default installation
- version : 6.3.0
- type : Protein 2D Structure
- description : Calculate and plot hydrophobic moment for protein sequence(s)
- analysis_extension :
- parameter :
- data :
- list :
- list_item :
- level : 0
- value : abi
- level : 0
- value : ace
- level : 0
- value : acedb
- level : 0
- value : bam
- level : 0
- value : biomart
- level : 0
- value : clustal
- level : 0
- value : codata
- level : 0
- value : dbid
- level : 0
- value : embl
- level : 0
- value : ensembl
- level : 0
- value : experiment
- level : 0
- value : fasta
- level : 0
- value : fastq
- level : 0
- value : fastq-illumina
- level : 0
- value : fastq-sanger
- level : 0
- value : fastq-solexa
- level : 0
- value : fitch
- level : 0
- value : gcg
- level : 0
- value : genbank
- level : 0
- value : genpept
- level : 0
- value : gff2
- level : 0
- value : gff3
- level : 0
- value : gifasta
- level : 0
- value : hennig86
- level : 0
- value : ig
- level : 0
- value : igstrict
- level : 0
- value : jackknifer
- level : 0
- value : mase
- level : 0
- value : mega
- level : 0
- value : msf
- level : 0
- value : nbrf
- level : 0
- value : nexus
- level : 0
- value : pdb
- level : 0
- value : pdbnuc
- level : 0
- value : pdbnucseq
- level : 0
- value : pdbseq
- level : 0
- value : pearson
- level : 0
- value : phylip
- level : 0
- value : phylipnon
- level : 0
- value : raw
- level : 0
- value : refseqp
- level : 0
- value : sam
- level : 0
- value : selex
- level : 0
- value : staden
- level : 0
- value : stockholm
- level : 0
- value : strider
- level : 0
- value : swiss
- level : 0
- value : text
- level : 0
- value : treecon
- type : full
- base :
- standard :
- list :
- list_item :
- shown_as : Portable Network Graphics (png)
- level : 0
- value : png
- shown_as : Postscript
- level : 0
- value : colourps
- type : full
- repeatable :
- base :
- range :
- format : %d
- repeatable :
- base :
- name : window
- ordering : 4
- option :
- name : EDAM:0001251
- type : normal
- value : data Window size
- default : 10
- qualifier : window
- mandatory : false
- prompt : Window
- type : long
- range :
- format : %d
- repeatable :
- base :
- name : aangle
- ordering : 5
- option :
- name : EDAM:0001773
- type : normal
- value : data Tool-specific parameter
- default : 100
- qualifier : aangle
- mandatory : false
- prompt : Alpha helix angle (degrees)
- type : long
- range :
- format : %d
- repeatable :
- base :
- name : bangle
- ordering : 6
- option :
- name : EDAM:0001773
- type : normal
- value : data Tool-specific parameter
- default : 160
- qualifier : bangle
- mandatory : false
- prompt : Beta sheet angle (degrees)
- type : long
- range :
- format : %f
- repeatable :
- base :
- name : baseline
- ordering : 9
- option :
- name : EDAM:0002152
- type : normal
- value : data Rendering parameter
- default : 0.35
- qualifier : baseline
- mandatory : false
- prompt : Graph marker line
- type : float
- base :
- name : plot
- ordering : 12
- option :
- name : EDAM:0002135
- type : normal
- value : data Toggle
- default : false
- qualifier : plot
- mandatory : false
- prompt : Produce graphic
- type : boolean
- base :
- name : double
- ordering : 13
- option :
- name : EDAM:0002135
- type : normal
- value : data Toggle
- default : false
- qualifier : double
- mandatory : false
- prompt : Plot two graphs
- type : boolean
- data :
- result :
- iotype : output
- base :
- data :
- result :
- iotype : output
- base :
- data :
- result :
- iotype : output
- base :
- name : Graphics_in_PNG
- ordering : 14
- option :
- name : EDAM:0001520
- type : normal
- value : data Peptide hydrophobic moment
- name : allow_non_existent
- type : normal
- value : true
- name : datatype
- type : normal
- value : bindata
- name : mimetype
- type : normal
- value : image/png
- name : nodisplay
- type : style
- value : true
- method : %%%Graphics_in_PNG%%% ${Graphics_in_PNG}
- qualifier : Graphics_in_PNG
- mandatory : false
- type : byte[][]
- option :
- name : EDAM:0000137
- type : normal
- value : topic Protein hydropathy
- name : EDAM:0000407
- type : normal
- value : operation Protein hydrophobic moment calculation
- name : emboss
- type : normal
- value : true
- name : installation
- type : normal
- value : Soaplab2 default installation
- name : version
- type : normal
- value : 6.3.0
- app_info :
- category : protein_2d_structure
- help_url : http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.3/emboss/apps/hmoment.html
- event :
- action :
- id : _E_1
- input :
- name : window
- default : 10
- mandatory : false
- type : long
- name : aangle
- default : 100
- mandatory : false
- type : long
- name : bangle
- default : 160
- mandatory : false
- type : long
- name : baseline
- default : 0.35
- mandatory : false
- type : float
- name : plot
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean
- name : double
- default : false
- mandatory : false
- type : boolean