banana SOAP Soaplab

This looks like a Soaplab service. Click here for more info and guidance on how to use this service

About Soaplab

Soaplab services are command line applications, wrapped as SOAP services, and served from a Soaplab server. All Soaplab services have the same generic set of SOAP operations (depending on the Soaplab version) as they all share a standardised interface.

Certain tools, like the Taverna workflow workbench, provide automatic support for the Soaplab way of executing these services. In some cases you will need to use the Soaplab Server Base URL rather than the WSDL location in these tools.
More information on Soaplab clients is available here.

Further documentation on Soaplab services is available:

Provider:
European Bioinformatics Institute (EBI)

Location:
UNITED KINGDOM

Submitter / Source:
Mike Mayer (about 1 year ago)

Base URL:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/nucleic_composition.banana

WSDL Location:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/nucleic_composition.banana?wsdl(download last cached WSDL file)

Documentation URL(s): None Login to add a documentation URL Description(s): No description(s) yet Login to add a description Details (from Soaplab server): from Soaplab server(about 1 month ago)

  • ds_lsr_analysis :
    • analysis :
      • name : banana
      • output :
      • type : Nucleic Composition
      • version : 6.3.0
      • installation : Soaplab2 default installation
      • description : Plot bending and curvature data for B-DNA
      • input :
      • analysis_extension :

Show all

  • ds_lsr_analysis :
    • analysis :
      • name : banana
      • output :
      • type : Nucleic Composition
      • version : 6.3.0
      • installation : Soaplab2 default installation
      • description : Plot bending and curvature data for B-DNA
      • input :
        • name : residuesperline
        • default : 50
        • mandatory : false
        • type : long
      • analysis_extension :
        • parameter :
          • data :
            • list :
              • list_item :
                • level : 0
                • value : abi
                • level : 0
                • value : ace
                • level : 0
                • value : acedb
                • level : 0
                • value : bam
                • level : 0
                • value : biomart
                • level : 0
                • value : clustal
                • level : 0
                • value : codata
                • level : 0
                • value : dbid
                • level : 0
                • value : embl
                • level : 0
                • value : ensembl
                • level : 0
                • value : experiment
                • level : 0
                • value : fasta
                • level : 0
                • value : fastq
                • level : 0
                • value : fastq-illumina
                • level : 0
                • value : fastq-sanger
                • level : 0
                • value : fastq-solexa
                • level : 0
                • value : fitch
                • level : 0
                • value : gcg
                • level : 0
                • value : genbank
                • level : 0
                • value : genpept
                • level : 0
                • value : gff2
                • level : 0
                • value : gff3
                • level : 0
                • value : gifasta
                • level : 0
                • value : hennig86
                • level : 0
                • value : ig
                • level : 0
                • value : igstrict
                • level : 0
                • value : jackknifer
                • level : 0
                • value : mase
                • level : 0
                • value : mega
                • level : 0
                • value : msf
                • level : 0
                • value : nbrf
                • level : 0
                • value : nexus
                • level : 0
                • value : pdb
                • level : 0
                • value : pdbnuc
                • level : 0
                • value : pdbnucseq
                • level : 0
                • value : pdbseq
                • level : 0
                • value : pearson
                • level : 0
                • value : phylip
                • level : 0
                • value : phylipnon
                • level : 0
                • value : raw
                • level : 0
                • value : refseqp
                • level : 0
                • value : sam
                • level : 0
                • value : selex
                • level : 0
                • value : staden
                • level : 0
                • value : stockholm
                • level : 0
                • value : strider
                • level : 0
                • value : swiss
                • level : 0
                • value : text
                • level : 0
                • value : treecon
              • type : full
          • base :
          • standard :
            • list :
              • list_item :
                • shown_as : Portable Network Graphics (png)
                • level : 0
                • value : png
                • shown_as : Postscript
                • level : 0
                • value : colourps
              • type : full
            • repeatable :
          • base :
          • data :
            • ioformat : unspecified
            • iotype : input
            • repeatable :
          • base :
          • range :
            • format : %d
            • repeatable :
          • base :
            • ordering : 7
            • name : residuesperline
            • option :
              • name : EDAM:0001249
              • value : data Sequence length
              • type : normal
            • qualifier : residuesperline
            • default : 50
            • mandatory : false
            • type : long
            • prompt : Number of residues to be displayed on each line
          • data :
            • result :
            • iotype : output
          • base :
          • data :
            • result :
            • iotype : output
          • base :
          • data :
            • result :
            • iotype : output
          • base :
            • ordering : 6
            • name : Graphics_in_PNG
            • option :
              • name : EDAM:0000913
              • value : data Nucleic acid structural property
              • type : normal
              • name : allow_non_existent
              • value : true
              • type : normal
              • name : datatype
              • value : bindata
              • type : normal
              • name : mimetype
              • value : image/png
              • type : normal
              • name : nodisplay
              • value : true
              • type : style
            • qualifier : Graphics_in_PNG
            • method : %%%Graphics_in_PNG%%% ${Graphics_in_PNG}
            • mandatory : false
            • type : byte[][]
        • option :
          • name : EDAM:0000097
          • value : topic Nucleic acid structure analysis
          • type : normal
          • name : EDAM:0000461
          • value : operation Nucleic acid curvature calculation
          • type : normal
          • name : emboss
          • value : true
          • type : normal
          • name : installation
          • value : Soaplab2 default installation
          • type : normal
          • name : version
          • value : 6.3.0
          • type : normal
        • app_info :
          • category : nucleic_composition
          • help_url : http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.3/emboss/apps/banana.html
        • event :
          • action :
          • id : _E_1

License(s): None Login to add license info Cost: No info yet Login to add cost info Usage Conditions: No info yet Login to add usage conditions info Contact Info: None Login to add contact info Publications: for this service. This can be a URI to the publication and/or a DOI. None Login to add publication info Citations: None Login to add a citation