eiprscan SOAP Soaplab

This looks like a Soaplab service. Click here for more info and guidance on how to use this service )

About Soaplab

Soaplab services are command line applications, wrapped as SOAP services, and served from a Soaplab server. All Soaplab services have the same generic set of SOAP operations (depending on the Soaplab version) as they all share a standardised interface.

Certain tools, like the Taverna workflow workbench, provide automatic support for the Soaplab way of executing these services. In some cases you will need to use the Soaplab Server Base URL rather than the WSDL location in these tools.
More information on Soaplab clients is available here.

Further documentation on Soaplab services is available:

Provider:
European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)

Location:
UNITED KINGDOM

Submitter/Source:
Gilles (over 8 years ago)

Base URL:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/protein_motifs.eiprscan

WSDL Location:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/protein_motifs.eiprscan?wsdl(download last cached WSDL file)

Documentation URL(s): None Login to add a documentation URL Description(s): No description(s) yet Login to add a description ELIXIR Description(s): No info yet Login to add an elixir description Details (from Soaplab server): from Soaplab server(over 8 years ago)

  • ds_lsr_analysis :
    • analysis :
      • name : eiprscan
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      • version : 6.3.0
      • type : Protein Motifs
      • description : Motif detection
      • analysis_extension :
      • input :

Show all

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    • analysis :
      • name : eiprscan
      • output :
      • installation : Soaplab2 default installation
      • version : 6.3.0
      • type : Protein Motifs
      • description : Motif detection
      • analysis_extension :
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            • name : trlen
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              • name : EDAM:
              • type : normal
              • value : Generic integer
              • name : scalemin
              • type : style
              • value : 1
            • help : Minimum size of Open Reading Frames (ORFs) in the translations.
            • default : 1
            • qualifier : trlen
            • mandatory : false
            • prompt : Minimum size of ORFs
            • type : long
          • base :
            • name : iprlookup
            • ordering : 26
            • option :
              • name : EDAM:
              • type : normal
              • value : Generic boolean
            • default : false
            • qualifier : iprlookup
            • mandatory : false
            • prompt : Turn on InterPro lookup for results
            • type : boolean
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            • name : goterms
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            • prompt : Show GO terms in InterPro lookup
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              • name : EDAM:
              • type : normal
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            • default : false
            • qualifier : crc
            • mandatory : false
            • prompt : Perform CRC64 check
            • type : boolean
          • base :
            • name : altjobs
            • ordering : 29
            • option :
              • name : EDAM:
              • type : normal
              • value : Generic boolean
            • default : false
            • qualifier : altjobs
            • mandatory : false
            • prompt : Launch jobs alternately (chunk after chunk)
            • type : boolean
        • option :
          • name : emboss
          • type : normal
          • value : true
          • name : installation
          • type : normal
          • value : Soaplab2 default installation
          • name : version
          • type : normal
          • value : 6.3.0
        • app_info :
          • category : protein_motifs
          • help_url : http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.3/emboss/apps/eiprscan.html
        • event :
          • action :
          • id : _E_1
      • input :
        • name : appl_all
        • default : true
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_blastprodom
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_coils
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_gene3d
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_hmmpanther
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_hmmpir
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_hmmpfam
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_hmmsmart
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_hmmtigr
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_fprintscan
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_scanregexp
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_profilescan
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_superfamily
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_seg
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_signalp
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : appl_tmhmm
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : trlen
        • default : 1
        • mandatory : false
        • type : long
        • name : iprlookup
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : goterms
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : crc
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : altjobs
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean

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