eyinoyang SOAP Soaplab

This looks like a Soaplab service. Click here for more info and guidance on how to use this service

About Soaplab

Soaplab services are command line applications, wrapped as SOAP services, and served from a Soaplab server. All Soaplab services have the same generic set of SOAP operations (depending on the Soaplab version) as they all share a standardised interface.

Certain tools, like the Taverna workflow workbench, provide automatic support for the Soaplab way of executing these services. In some cases you will need to use the Soaplab Server Base URL rather than the WSDL location in these tools.
More information on Soaplab clients is available here.

Further documentation on Soaplab services is available:

Provider:
European Bioinformatics Institute (EBI)

Location:
UNITED KINGDOM

Submitter / Source:
Gilles (29 days ago)

Base URL:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/protein_motifs.eyinoyang

WSDL Location:
http://www.ebi.ac.uk/soaplab/services/protein_motifs.eyinoyang?wsdl(download last cached WSDL file)

Documentation URL(s): None Login to add a documentation URL Description(s): No description(s) yet Login to add a description Details (from Soaplab server): from Soaplab server(8 days ago)

  • ds_lsr_analysis :
    • analysis :
      • name : eyinoyang
      • output :
      • type : Protein Motifs
      • version : 6.3.0
      • installation : Soaplab2 default installation
      • description : Reports O-(beta)-GlcNAc attachment sites
      • input :
      • analysis_extension :

Show all

  • ds_lsr_analysis :
    • analysis :
      • name : eyinoyang
      • output :
      • type : Protein Motifs
      • version : 6.3.0
      • installation : Soaplab2 default installation
      • description : Reports O-(beta)-GlcNAc attachment sites
      • input :
        • name : plot
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : netphos
        • default : false
        • mandatory : false
        • type : boolean
        • name : threshold
        • default : 0.5
        • mandatory : false
        • type : float
      • analysis_extension :
        • parameter :
          • data :
            • list :
              • list_item :
                • level : 0
                • value : abi
                • level : 0
                • value : ace
                • level : 0
                • value : acedb
                • level : 0
                • value : bam
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                • level : 0
                • value : clustal
                • level : 0
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                • level : 0
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                • level : 0
                • value : experiment
                • level : 0
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                • level : 0
                • value : genbank
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                • level : 0
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                • level : 0
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                • level : 0
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                • value : ig
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                • level : 0
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                • level : 0
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                • level : 0
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                • level : 0
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                • level : 0
                • value : pdbseq
                • level : 0
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                • level : 0
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              • type : full
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          • data :
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            • iotype : output
          • base :
          • base :
            • ordering : 5
            • name : plot
            • option :
              • name : EDAM:
              • value : Generic boolean
              • type : normal
            • qualifier : plot
            • default : false
            • mandatory : false
            • type : boolean
            • prompt : Produce graphics
          • standard :
            • list :
              • name : Output format
              • list_item :
                • shown_as : short
                • level : 0
                • value : short
                • shown_as : long
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                • value : long
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            • repeatable :
          • base :
          • base :
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            • option :
              • name : EDAM:
              • value : Generic boolean
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            • qualifier : netphos
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            • mandatory : false
            • type : boolean
            • prompt : Run netphos and predict Yin-Yang sites
          • range :
            • format : %f
            • max : 1.0
            • min : 0.0
            • repeatable :
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            • ordering : 8
            • name : threshold
            • option :
              • name : EDAM:
              • value : Generic float
              • type : normal
              • name : scalemax
              • value : 1.0
              • type : style
              • name : scalemin
              • value : 0.0
              • type : style
            • qualifier : threshold
            • default : 0.5
            • mandatory : false
            • type : float
            • prompt : Report netphos only scores above this value
        • option :
          • name : emboss
          • value : true
          • type : normal
          • name : installation
          • value : Soaplab2 default installation
          • type : normal
          • name : version
          • value : 6.3.0
          • type : normal
        • app_info :
          • category : protein_motifs
          • help_url : http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.3/emboss/apps/eyinoyang.html
        • event :
          • action :
          • id : _E_1

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